Ce 5 km reprend en partie le parcours du 10 km couru le même jour.

Il s'agit de faire deux fois le parcours suivant : Boulevard du champ de Mars, Boulevard du Général Leclerc, Lycée Bartholdi, Boulevard St-Pierre, rue Schwendi, rue de l'Est, rue de l'Ours, rue Vauban, Place Jeanne-d'arc, rue des clefs (on coupe ici par rapport au 10km qui va jusqu'au Musée Unterlinden), rue Saint-Nicolas, Collégial St-Martin, rue de l'Eglise, Koifhus, Prison, rue Augustin, rue porte neuve.